Действительно, порты есть. Хотя грузопассажирских не так много, на Коста Бланка это Аликанте и Дения, пожалуй.
В остальных городах это т.н. "puerto deportivo" - "спортивный порт", для личных яхт и катеров, от него и вовсе не стоит ожидать подвоха, слив отходов в воду запрещен, и, что важно, это правило соблюдается.
Все оборудованные пляжи побережья имеют "голубой флаг" - международная награда, ежегодно вручаемая пляжам и причалам, вода в которых отвечает высоким стандартам качества и пригодна для безопасного купания. Соответствие критериям Голубого флага требует соблюдения строгих стандартов качества воды, безопасности и экологического просвещения. Для мест, расположенных в странах Евросоюза необходимо также полное соблюдение принятых директив (источник).
Так что переживать совершенно не о чем, пляжи чистые и безопасные, а летом каждую ночь чистятся тракторами.